胃疼按摩腹部时是否会影响到卵巢囊肿是根据情况而定的。若囊肿较小，且在专业医生指导下进行腹部按摩，一般不会影响。若囊肿较大，且按摩方法和力道不恰当，可能会引发囊肿破裂和扭转，甚至会引起大出血等现象。

如果卵巢囊肿患者出现胃疼情况，可以对腹部进行按摩，能起到一定的缓解作用，一般也不会导致疾病严重。因为卵巢属于内生殖器在盆腔里，卵巢囊肿位于卵巢内，而胃部在上腹部，两者位置较远。且按摩通常只存在于肌肤表面，囊肿较小通常不会受到刺激，不会对囊肿造成外因性的刺激和伤害，引发不适症状，更加不会导致病情有所加重。因此可以在医生指导下进行腹部按摩，但应避免用力过度。

但是当囊肿较大时，在下腹部出现肿块的现象，这时千万不能盲目按摩腹部，若此时进行腹部按摩会增加腹部压力，或用力不当容易造成囊肿破裂或是蒂扭转引发疼痛、呕吐等症状，甚至出现大出血，引起失血性休克。

卵巢囊肿可能与激素、环境、饮食以及感染等多个方面有关，囊肿具有一定的增长性，一般囊肿较小不会导致身体有所不适，随着囊肿持续增大或继发感染等问题后，有可能会引起卵巢囊肿破裂、卵巢囊肿蒂扭转等问题。患卵巢囊肿若身体无明显不适且囊肿较小，可以定期复查。反之，则要在医生指导下采取药物治疗措施，如口服金鸡胶囊、消炎宝合剂等，病情较严重则采取手术治疗措施。

胃疼情况发生后，可以通过局部热敷方式缓解疼痛症状，并且可以在医生指导下采取药物治疗措施，如奥美拉唑胶囊、雷贝拉唑胶囊等。